Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CFAP47Q6ZTR5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CFAP47Q6ZTR5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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