Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
CASC2Q6XLA1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
CASC2Q6XLA1 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms