Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
NHLRC1Q6VVB1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms