Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCBE1Q6UXH8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms