Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 RPS2-214ENST00000533186 625 ntTSL 38.02□□□□□ -1.133e-11■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 RPS2-212ENST00000532746 931 ntTSL 37.76□□□□□ -1.173e-11■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.791e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.931e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.27e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.37e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.327e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.337e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.981e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.421e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MCOLN1-205ENST00000596008 772 ntTSL 315.92■□□□□ 0.141e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-205ENST00000526294 550 ntTSL 314.98□□□□□ -0.011e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-202ENST00000414624 1452 ntTSL 214.28□□□□□ -0.121e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 BCL2L12-209ENST00000601168 416 ntTSL 213.84□□□□□ -0.191e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MCOLN1-209ENST00000601003 666 ntTSL 313.76□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MCOLN1-207ENST00000598406 644 ntTSL 313.71□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.311e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-210ENST00000531956 841 ntTSL 512.46□□□□□ -0.411e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-206ENST00000527379 768 ntTSL 312.39□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-212ENST00000534223 800 ntTSL 511.63□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MCOLN1-202ENST00000394321 2253 ntTSL 211.61□□□□□ -0.551e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-211ENST00000533676 5314 ntTSL 211.41□□□□□ -0.581e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FADS3-208ENST00000529404 2379 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 CC2D1A-204ENST00000587508 1667 ntTSL 516.14■□□□□ 0.171e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UTP6-201ENST00000261708 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.433e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 PAFAH1B1-212ENST00000609078 570 ntTSL 41.73□□□□□ -2.132e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SAFB-207ENST00000589863 2708 ntTSL 212.96□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.554e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.624e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.664e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 TNPO2-217ENST00000590781 547 ntTSL 47.58□□□□□ -1.22e-6■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 EZH2-205ENST00000476773 2572 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.176e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MYO1C-208ENST00000571715 541 ntTSL 414.55□□□□□ -0.084e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MYO1C-216ENST00000574790 555 ntTSL 414.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MYO1C-205ENST00000570490 565 ntTSL 412.88□□□□□ -0.354e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MYO1C-219ENST00000575335 753 ntTSL 511.93□□□□□ -0.54e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHM2-203ENST00000462455 509 ntTSL 511.4□□□□□ -0.584e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIM41-208ENST00000515499 914 ntTSL 317.35■□□□□ 0.378e-16■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 TRIM41-209ENST00000515834 7015 ntTSL 1 (best)8.79□□□□□ -18e-16■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 EIF4A1-205ENST00000577738 531 ntTSL 210.86□□□□□ -0.675e-11■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 PKD1-229ENST00000564890 574 ntTSL 515.67■□□□□ 0.14e-9■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 PKD1-228ENST00000564865 480 ntTSL 511.45□□□□□ -0.584e-9■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 RTCB-201ENST00000216038 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.095e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.751e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.781e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 OFD1-201ENST00000340096 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.881e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 OFD1-203ENST00000380567 3736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.911e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 OFD1-209ENST00000490265 4259 ntTSL 29.01□□□□□ -0.971e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NXN-204ENST00000571281 1047 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.28e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 TAF1C-214ENST00000565544 578 ntTSL 411.49□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NXN-207ENST00000574018 508 ntTSL 36.95□□□□□ -1.38e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 PHF20-204ENST00000420233 384 ntTSL 34.67□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-204ENST00000546630 544 ntTSL 1 (best)12.17□□□□□ -0.461e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MYL6-217ENST00000550639 419 ntTSL 58.03□□□□□ -1.121e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 PLEKHA7-209ENST00000529213 561 ntTSL 49.78□□□□□ -0.843e-31■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L-209ENST00000487700 472 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 RAD54L-211ENST00000493032 627 ntTSL 36.62□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 HNRNPC-204ENST00000449098 1599 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.782e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 AC093752.1-208ENST00000498873 981 ntTSL 53.16□□□□□ -1.91e-6■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 VCP-203ENST00000448530 950 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-6■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 DDB1-206ENST00000535283 1220 ntTSL 27.87□□□□□ -1.156e-13■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 DDB1-210ENST00000538129 475 ntTSL 25.01□□□□□ -1.616e-13■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.794e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.584e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.324e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.364e-8■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.074e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-205ENST00000459858 795 ntTSL 521■□□□□ 0.954e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.734e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-209ENST00000494584 788 ntTSL 513.66□□□□□ -0.224e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-208ENST00000491309 2237 ntTSL 213.09□□□□□ -0.314e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.464e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 UCK1-202ENST00000372210 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.744e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 HAUS3-205ENST00000514395 580 ntTSL 419.52■□□□□ 0.711e-14■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 HAUS3-203ENST00000502440 574 ntTSL 416.52■□□□□ 0.241e-14■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-211ENST00000490200 563 ntTSL 416.51■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-204ENST00000440042 552 ntTSL 316.2■□□□□ 0.183e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-206ENST00000461711 528 ntTSL 415.05■□□□□ -03e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 COX4I1-209ENST00000565078 566 ntTSL 412.25□□□□□ -0.451e-39■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.672e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-205ENST00000457954 647 ntTSL 49.84□□□□□ -0.833e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MAP2K4-210ENST00000585076 543 ntTSL 44.77□□□□□ -1.652e-10■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 ORC4-203ENST00000416719 571 ntTSL 32.25□□□□□ -2.053e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 HSPH1-207ENST00000626866 4381 ntTSL 20.79□□□□□ -2.284e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NUMA1-224ENST00000543009 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 311.72□□□□□ -0.533e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MTOR-206ENST00000490931 1111 ntTSL 511.26□□□□□ -0.619e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 MTOR-203ENST00000455339 694 ntTSL 310.47□□□□□ -0.739e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.89e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SPTY2D1-202ENST00000536336 2167 ntTSL 210.02□□□□□ -0.819e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NUMA1-215ENST00000537930 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.84□□□□□ -0.833e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NUMA1-227ENST00000544129 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 59.29□□□□□ -0.923e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 COPS2-201ENST00000299259 2036 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.069e-7■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 LINC00854-214ENST00000615433 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 58.36□□□□□ -1.071e-9■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NUMA1-228ENST00000544238 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 38.17□□□□□ -1.13e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 LINC00854-204ENST00000594691 649 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.161e-9■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 NUMA1-211ENST00000535947 576 ntAPPRIS ALT2 TSL 47.81□□□□□ -1.163e-12■■■■■ 32.5
PRPF8Q6P2Q9 SPTY2D1-203ENST00000543776 543 ntTSL 47.75□□□□□ -1.179e-7■■■■■ 32.5
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 614.5 ms