Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMYD5Q6GMV2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMYD5Q6GMV2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms