Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CARMIL2Q6F5E8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CARMIL2Q6F5E8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms