Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RNF123Q5XPI4 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RNF123Q5XPI4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms