Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LGSNQ5TDP6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LGSNQ5TDP6 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms