Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATAD3CQ5T2N8 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms