Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LDLRAP1Q5SW96 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LDLRAP1Q5SW96 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms