Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.05■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
FAM74A1Q5RGS3 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms