Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KLHL22Q53GT1 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms