Protein–RNA interactions for Protein: Q494V2

CFAP100, Cilia- and flagella-associated protein 100, humanhuman

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP100Q494V2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP100Q494V2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
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