Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FAM187BQ17R55 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FAM187BQ17R55 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms