Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDKN3Q16667 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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