Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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NRF1Q16656 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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NRF1Q16656 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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NRF1Q16656 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NRF1Q16656 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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