Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RBBP7Q16576 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms