Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SNAPC1Q16533 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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