Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSRP2Q16527 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSRP2Q16527 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSRP2Q16527 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSRP2Q16527 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CSRP2Q16527 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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