Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TNXAQ16473 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
TNXAQ16473 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms