Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LAMA4Q16363 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
LAMA4Q16363 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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