Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
ATXN8Q156A1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms