Protein–RNA interactions for Protein: Q15406

NR6A1, Nuclear receptor subfamily 6 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR6A1Q15406 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NR6A1Q15406 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NR6A1Q15406 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms