Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NECTIN1Q15223 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NECTIN1Q15223 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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