Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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LAPTM4AQ15012 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
LAPTM4AQ15012 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LAPTM4AQ15012 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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