Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
GPNMBQ14956 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms