Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

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Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SQLEQ14534 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SQLEQ14534 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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