Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM29Q14134 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRIM29Q14134 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRIM29Q14134 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM29Q14134 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM29Q14134 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM29Q14134 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRIM29Q14134 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
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