Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CACNA1CQ13936 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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