Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SPTAN1Q13813 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SPTAN1Q13813 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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