Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC1Q13547 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
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