Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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BFSP2Q13515 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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BFSP2Q13515 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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BFSP2Q13515 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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BFSP2Q13515 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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BFSP2Q13515 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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BFSP2Q13515 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BFSP2Q13515 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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