Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
FOXE3Q13461 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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FOXE3Q13461 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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FOXE3Q13461 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
FOXE3Q13461 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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