Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
XRCC4Q13426 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
XRCC4Q13426 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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