Protein–RNA interactions for Protein: Q13422

IKZF1, DNA-binding protein Ikaros, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF1Q13422 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IKZF1Q13422 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms