Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
NR1H3Q13133 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NR1H3Q13133 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms