Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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