Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PTPRJQ12913 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PTPRJQ12913 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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