Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
BPTFQ12830 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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