Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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