Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCAPQ12770 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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