Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
NUP160Q12769 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NUP160Q12769 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms