Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SLC3A1Q07837 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms