Protein–RNA interactions for Protein: Q07699

SCN1B, Sodium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN1BQ07699 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SCN1BQ07699 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms