Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms