Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ZNF85Q03923 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ZNF85Q03923 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms