Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF8Q02556 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF8Q02556 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms