Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
DSG1Q02413 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
DSG1Q02413 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms