Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PLCB3Q01970 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLCB3Q01970 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLCB3Q01970 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLCB3Q01970 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PLCB3Q01970 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms